]> arthur.barton.de Git - bup.git/blobdiff - lib/bup/git.py
Combine and speed up idx->midx and bupindex merge
[bup.git] / lib / bup / git.py
index c7d4f728cc6684ab9c614d14b2ac9dd95e621dab..cd1682afc009b2f3b09d46fb6a8cf0b00e0c3cf7 100644 (file)
@@ -1,6 +1,12 @@
-import os, errno, zlib, time, subprocess, struct, stat, re, tempfile
-import heapq
+"""Git interaction library.
+bup repositories are in Git format. This library allows us to
+interact with the Git data structures.
+"""
+import os, sys, zlib, time, subprocess, struct, stat, re, tempfile
 from bup.helpers import *
+from bup import _helpers, path
+
+MIDX_VERSION = 2
 
 verbose = 0
 ignore_midx = 0
@@ -10,21 +16,74 @@ repodir = None
 _typemap =  { 'blob':3, 'tree':2, 'commit':1, 'tag':4 }
 _typermap = { 3:'blob', 2:'tree', 1:'commit', 4:'tag' }
 
+_total_searches = 0
+_total_steps = 0
+
 
 class GitError(Exception):
     pass
 
 
 def repo(sub = ''):
+    """Get the path to the git repository or one of its subdirectories."""
     global repodir
     if not repodir:
         raise GitError('You should call check_repo_or_die()')
+
+    # If there's a .git subdirectory, then the actual repo is in there.
     gd = os.path.join(repodir, '.git')
     if os.path.exists(gd):
         repodir = gd
+
     return os.path.join(repodir, sub)
 
 
+def auto_midx(objdir):
+    args = [path.exe(), 'midx', '--auto', '--dir', objdir]
+    try:
+        rv = subprocess.call(args, stdout=open('/dev/null', 'w'))
+    except OSError, e:
+        # make sure 'args' gets printed to help with debugging
+        add_error('%r: exception: %s' % (args, e))
+        raise
+    if rv:
+        add_error('%r: returned %d' % (args, rv))
+
+
+def mangle_name(name, mode, gitmode):
+    """Mangle a file name to present an abstract name for segmented files.
+    Mangled file names will have the ".bup" extension added to them. If a
+    file's name already ends with ".bup", a ".bupl" extension is added to
+    disambiguate normal files from semgmented ones.
+    """
+    if stat.S_ISREG(mode) and not stat.S_ISREG(gitmode):
+        return name + '.bup'
+    elif name.endswith('.bup') or name[:-1].endswith('.bup'):
+        return name + '.bupl'
+    else:
+        return name
+
+
+(BUP_NORMAL, BUP_CHUNKED) = (0,1)
+def demangle_name(name):
+    """Remove name mangling from a file name, if necessary.
+
+    The return value is a tuple (demangled_filename,mode), where mode is one of
+    the following:
+
+    * BUP_NORMAL  : files that should be read as-is from the repository
+    * BUP_CHUNKED : files that were chunked and need to be assembled
+
+    For more information on the name mangling algorythm, see mangle_name()
+    """
+    if name.endswith('.bupl'):
+        return (name[:-5], BUP_NORMAL)
+    elif name.endswith('.bup'):
+        return (name[:-4], BUP_CHUNKED)
+    else:
+        return (name, BUP_NORMAL)
+
+
 def _encode_packobj(type, content):
     szout = ''
     sz = len(content)
@@ -82,14 +141,80 @@ def _decode_packobj(buf):
 
 
 class PackIdx:
-    def __init__(self, filename):
+    def __init__(self):
+        assert(0)
+
+    def find_offset(self, hash):
+        """Get the offset of an object inside the index file."""
+        idx = self._idx_from_hash(hash)
+        if idx != None:
+            return self._ofs_from_idx(idx)
+        return None
+
+    def exists(self, hash):
+        """Return nonempty if the object exists in this index."""
+        return hash and (self._idx_from_hash(hash) != None) and True or None
+
+    def __len__(self):
+        return int(self.fanout[255])
+
+    def _idx_from_hash(self, hash):
+        global _total_searches, _total_steps
+        _total_searches += 1
+        assert(len(hash) == 20)
+        b1 = ord(hash[0])
+        start = self.fanout[b1-1] # range -1..254
+        end = self.fanout[b1] # range 0..255
+        want = str(hash)
+        _total_steps += 1  # lookup table is a step
+        while start < end:
+            _total_steps += 1
+            mid = start + (end-start)/2
+            v = self._idx_to_hash(mid)
+            if v < want:
+                start = mid+1
+            elif v > want:
+                end = mid
+            else: # got it!
+                return mid
+        return None
+
+
+class PackIdxV1(PackIdx):
+    """Object representation of a Git pack index (version 1) file."""
+    def __init__(self, filename, f):
         self.name = filename
-        self.map = mmap_read(open(filename))
+        self.idxnames = [self.name]
+        self.map = mmap_read(f)
+        self.fanout = list(struct.unpack('!256I',
+                                         str(buffer(self.map, 0, 256*4))))
+        self.fanout.append(0)  # entry "-1"
+        nsha = self.fanout[255]
+        self.shatable = buffer(self.map, 256*4, nsha*24)
+
+    def _ofs_from_idx(self, idx):
+        return struct.unpack('!I', str(self.shatable[idx*24 : idx*24+4]))[0]
+
+    def _idx_to_hash(self, idx):
+        return str(self.shatable[idx*24+4 : idx*24+24])
+
+    def __iter__(self):
+        for i in xrange(self.fanout[255]):
+            yield buffer(self.map, 256*4 + 24*i + 4, 20)
+
+
+class PackIdxV2(PackIdx):
+    """Object representation of a Git pack index (version 2) file."""
+    def __init__(self, filename, f):
+        self.name = filename
+        self.idxnames = [self.name]
+        self.map = mmap_read(f)
         assert(str(self.map[0:8]) == '\377tOc\0\0\0\2')
         self.fanout = list(struct.unpack('!256I',
                                          str(buffer(self.map, 8, 256*4))))
         self.fanout.append(0)  # entry "-1"
         nsha = self.fanout[255]
+        self.shatable = buffer(self.map, 8 + 256*4, nsha*20)
         self.ofstable = buffer(self.map,
                                8 + 256*4 + nsha*20 + nsha*4,
                                nsha*4)
@@ -100,102 +225,109 @@ class PackIdx:
         ofs = struct.unpack('!I', str(buffer(self.ofstable, idx*4, 4)))[0]
         if ofs & 0x80000000:
             idx64 = ofs & 0x7fffffff
-            ofs = struct.unpack('!I',
+            ofs = struct.unpack('!Q',
                                 str(buffer(self.ofs64table, idx64*8, 8)))[0]
         return ofs
 
-    def _idx_from_hash(self, hash):
-        assert(len(hash) == 20)
-        b1 = ord(hash[0])
-        start = self.fanout[b1-1] # range -1..254
-        end = self.fanout[b1] # range 0..255
-        buf = buffer(self.map, 8 + 256*4, end*20)
-        want = str(hash)
-        while start < end:
-            mid = start + (end-start)/2
-            v = str(buf[mid*20:(mid+1)*20])
-            if v < want:
-                start = mid+1
-            elif v > want:
-                end = mid
-            else: # got it!
-                return mid
-        return None
-        
-    def find_offset(self, hash):
-        idx = self._idx_from_hash(hash)
-        if idx != None:
-            return self._ofs_from_idx(idx)
-        return None
-
-    def exists(self, hash):
-        return hash and (self._idx_from_hash(hash) != None) and True or None
+    def _idx_to_hash(self, idx):
+        return str(self.shatable[idx*20:(idx+1)*20])
 
     def __iter__(self):
         for i in xrange(self.fanout[255]):
             yield buffer(self.map, 8 + 256*4 + 20*i, 20)
 
-    def __len__(self):
-        return int(self.fanout[255])
 
-
-def extract_bits(buf, bits):
-    mask = (1<<bits) - 1
-    v = struct.unpack('!I', buf[0:4])[0]
-    v = (v >> (32-bits)) & mask
-    return v
+extract_bits = _helpers.extract_bits
 
 
 class PackMidx:
+    """Wrapper which contains data from multiple index files.
+    Multiple index (.midx) files constitute a wrapper around index (.idx) files
+    and make it possible for bup to expand Git's indexing capabilities to vast
+    amounts of files.
+    """
     def __init__(self, filename):
         self.name = filename
+        self.force_keep = False
         assert(filename.endswith('.midx'))
         self.map = mmap_read(open(filename))
-        if str(self.map[0:8]) == 'MIDX\0\0\0\1':
-            log('Warning: ignoring old-style midx %r\n' % filename)
-            self.bits = 0
-            self.entries = 1
-            self.fanout = buffer('\0\0\0\0')
-            self.shalist = buffer('\0'*20)
-            self.idxnames = []
-        else:
-            assert(str(self.map[0:8]) == 'MIDX\0\0\0\2')
-            self.bits = struct.unpack('!I', self.map[8:12])[0]
-            self.entries = 2**self.bits
-            self.fanout = buffer(self.map, 12, self.entries*4)
-            shaofs = 12 + self.entries*4
-            nsha = self._fanget(self.entries-1)
-            self.shalist = buffer(self.map, shaofs, nsha*20)
-            self.idxnames = str(self.map[shaofs + 20*nsha:]).split('\0')
+        if str(self.map[0:4]) != 'MIDX':
+            log('Warning: skipping: invalid MIDX header in %r\n' % filename)
+            self.force_keep = True
+            return self._init_failed()
+        ver = struct.unpack('!I', self.map[4:8])[0]
+        if ver < MIDX_VERSION:
+            log('Warning: ignoring old-style (v%d) midx %r\n' 
+                % (ver, filename))
+            self.force_keep = False  # old stuff is boring  
+            return self._init_failed()
+        if ver > MIDX_VERSION:
+            log('Warning: ignoring too-new (v%d) midx %r\n'
+                % (ver, filename))
+            self.force_keep = True  # new stuff is exciting
+            return self._init_failed()
+
+        self.bits = _helpers.firstword(self.map[8:12])
+        self.entries = 2**self.bits
+        self.fanout = buffer(self.map, 12, self.entries*4)
+        shaofs = 12 + self.entries*4
+        nsha = self._fanget(self.entries-1)
+        self.shalist = buffer(self.map, shaofs, nsha*20)
+        self.idxnames = str(self.map[shaofs + 20*nsha:]).split('\0')
+
+    def _init_failed(self):
+        self.bits = 0
+        self.entries = 1
+        self.fanout = buffer('\0\0\0\0')
+        self.shalist = buffer('\0'*20)
+        self.idxnames = []
 
     def _fanget(self, i):
         start = i*4
         s = self.fanout[start:start+4]
-        return struct.unpack('!I', s)[0]
-    
+        return _helpers.firstword(s)
+
+    def _get(self, i):
+        return str(self.shalist[i*20:(i+1)*20])
+
     def exists(self, hash):
+        """Return nonempty if the object exists in the index files."""
+        global _total_searches, _total_steps
+        _total_searches += 1
         want = str(hash)
         el = extract_bits(want, self.bits)
         if el:
             start = self._fanget(el-1)
+            startv = el << (32-self.bits)
         else:
             start = 0
+            startv = 0
         end = self._fanget(el)
+        endv = (el+1) << (32-self.bits)
+        _total_steps += 1   # lookup table is a step
+        hashv = _helpers.firstword(hash)
+        #print '(%08x) %08x %08x %08x' % (extract_bits(want, 32), startv, hashv, endv)
         while start < end:
-            mid = start + (end-start)/2
-            v = str(self.shalist[mid*20:(mid+1)*20])
+            _total_steps += 1
+            #print '! %08x %08x %08x   %d - %d' % (startv, hashv, endv, start, end)
+            mid = start + (hashv-startv)*(end-start-1)/(endv-startv)
+            #print '  %08x %08x %08x   %d %d %d' % (startv, hashv, endv, start, mid, end)
+            v = self._get(mid)
+            #print '    %08x' % self._num(v)
             if v < want:
                 start = mid+1
+                startv = _helpers.firstword(v)
             elif v > want:
                 end = mid
+                endv = _helpers.firstword(v)
             else: # got it!
                 return True
         return None
-    
+
     def __iter__(self):
         for i in xrange(self._fanget(self.entries-1)):
             yield buffer(self.shalist, i*20, 20)
-    
+
     def __len__(self):
         return int(self._fanget(self.entries-1))
 
@@ -219,11 +351,18 @@ class PackIdxList:
     def __iter__(self):
         return iter(idxmerge(self.packs))
 
+    def __len__(self):
+        return sum(len(pack) for pack in self.packs)
+
     def exists(self, hash):
+        """Return nonempty if the object exists in the index files."""
+        global _total_searches
+        _total_searches += 1
         if hash in self.also:
             return True
         for i in range(len(self.packs)):
             p = self.packs[i]
+            _total_searches -= 1  # will be incremented by sub-pack
             if p.exists(hash):
                 # reorder so most recently used packs are searched first
                 self.packs = [p] + self.packs[:i] + self.packs[i+1:]
@@ -231,6 +370,17 @@ class PackIdxList:
         return None
 
     def refresh(self, skip_midx = False):
+        """Refresh the index list.
+        This method verifies if .midx files were superseded (e.g. all of its
+        contents are in another, bigger .midx file) and removes the superseded
+        files.
+
+        If skip_midx is True, all work on .midx files will be skipped and .midx
+        files will be removed from the list.
+
+        The module-global variable 'ignore_midx' can force this function to
+        always act as if skip_midx was True.
+        """
         skip_midx = skip_midx or ignore_midx
         d = dict((p.name, p) for p in self.packs
                  if not skip_midx or not isinstance(p, PackMidx))
@@ -252,7 +402,10 @@ class PackIdxList:
                                 log(('warning: index %s missing\n' +
                                     '  used by %s\n') % (n, mxf))
                                 broken += 1
-                        if not broken:
+                        if broken:
+                            del mx
+                            unlink(full)
+                        else:
                             midxl.append(mx)
                 midxl.sort(lambda x,y: -cmp(len(x),len(y)))
                 for ix in midxl:
@@ -266,27 +419,50 @@ class PackIdxList:
                                 d[os.path.join(self.dir, name)] = ix
                             any += 1
                             break
-                    if not any:
-                        log('midx: removing redundant: %s\n' 
-                            % os.path.basename(ix.name))
+                    if not any and not ix.force_keep:
+                        debug1('midx: removing redundant: %s\n'
+                               % os.path.basename(ix.name))
                         unlink(ix.name)
             for f in os.listdir(self.dir):
                 full = os.path.join(self.dir, f)
                 if f.endswith('.idx') and not d.get(full):
-                    ix = PackIdx(full)
+                    try:
+                        ix = open_idx(full)
+                    except GitError, e:
+                        add_error(e)
+                        continue
                     d[full] = ix
             self.packs = list(set(d.values()))
-        log('PackIdxList: using %d index%s.\n' 
+        debug1('PackIdxList: using %d index%s.\n'
             % (len(self.packs), len(self.packs)!=1 and 'es' or ''))
 
+    def packname_containing(self, hash):
+        # figure out which pack contains a given hash.
+        # FIXME: if the midx file format would just *store* this information,
+        # we could calculate it a lot more efficiently.  But it's not needed
+        # often, so let's do it like this.
+        for f in os.listdir(self.dir):
+            if f.endswith('.idx'):
+                full = os.path.join(self.dir, f)
+                try:
+                    ix = open_idx(full)
+                except GitError, e:
+                    add_error(e)
+                    continue
+                if ix.exists(hash):
+                    return full
+
     def add(self, hash):
+        """Insert an additional object in the list."""
         self.also[hash] = 1
 
     def zap_also(self):
+        """Remove all additional objects from the list."""
         self.also = {}
 
 
 def calc_hash(type, content):
+    """Calculate some content's hash in the Git fashion."""
     header = '%s %d\0' % (type, len(content))
     sum = Sha1(header)
     sum.update(content)
@@ -301,59 +477,67 @@ def _shalist_sort_key(ent):
         return name
 
 
-def idxmerge(idxlist):
-    total = sum(len(i) for i in idxlist)
-    iters = (iter(i) for i in idxlist)
-    heap = [(next(it), it) for it in iters]
-    heapq.heapify(heap)
-    count = 0
-    last = None
-    while heap:
-        if (count % 10024) == 0:
-            progress('Reading indexes: %.2f%% (%d/%d)\r'
-                     % (count*100.0/total, count, total))
-        (e, it) = heap[0]
-        if e != last:
-            yield e
-            last = e
-        count += 1
-        e = next(it)
-        if e:
-            heapq.heapreplace(heap, (e, it))
+def open_idx(filename):
+    if filename.endswith('.idx'):
+        f = open(filename, 'rb')
+        header = f.read(8)
+        if header[0:4] == '\377tOc':
+            version = struct.unpack('!I', header[4:8])[0]
+            if version == 2:
+                return PackIdxV2(filename, f)
+            else:
+                raise GitError('%s: expected idx file version 2, got %d'
+                               % (filename, version))
+        elif len(header) == 8 and header[0:4] < '\377tOc':
+            return PackIdxV1(filename, f)
         else:
-            heapq.heappop(heap)
-    log('Reading indexes: %.2f%% (%d/%d), done.\n' % (100, total, total))
+            raise GitError('%s: unrecognized idx file header' % filename)
+    elif filename.endswith('.midx'):
+        return PackMidx(filename)
+    else:
+        raise GitError('idx filenames must end with .idx or .midx')
+
+
+def idxmerge(idxlist, final_progress=True):
+    """Generate a list of all the objects reachable in a PackIdxList."""
+    def pfunc(count, total):
+        progress('Reading indexes: %.2f%% (%d/%d)\r'
+                 % (count*100.0/total, count, total))
+    def pfinal(count, total):
+        if final_progress:
+            log('Reading indexes: %.2f%% (%d/%d), done.\n' % (100, total, total))
+    return merge_iter(idxlist, 10024, pfunc, pfinal)
+
+
+def _make_objcache():
+    return PackIdxList(repo('objects/pack'))
 
-    
 class PackWriter:
-    def __init__(self, objcache_maker=None):
+    """Writes Git objects insid a pack file."""
+    def __init__(self, objcache_maker=_make_objcache):
         self.count = 0
         self.outbytes = 0
         self.filename = None
         self.file = None
+        self.idx = None
         self.objcache_maker = objcache_maker
         self.objcache = None
 
     def __del__(self):
         self.close()
 
-    def _make_objcache(self):
-        if not self.objcache:
-            if self.objcache_maker:
-                self.objcache = self.objcache_maker()
-            else:
-                self.objcache = PackIdxList(repo('objects/pack'))
-
     def _open(self):
         if not self.file:
-            self._make_objcache()
             (fd,name) = tempfile.mkstemp(suffix='.pack', dir=repo('objects'))
             self.file = os.fdopen(fd, 'w+b')
             assert(name.endswith('.pack'))
             self.filename = name[:-5]
             self.file.write('PACK\0\0\0\2\0\0\0\0')
+            self.idx = list(list() for i in xrange(256))
 
-    def _raw_write(self, datalist):
+    # the 'sha' parameter is used in client.py's _raw_write(), but not needed
+    # in this basic version.
+    def _raw_write(self, datalist, sha):
         self._open()
         f = self.file
         # in case we get interrupted (eg. KeyboardInterrupt), it's best if
@@ -362,40 +546,67 @@ class PackWriter:
         # to our hashsplit algorithm.)  f.write() does its own buffering,
         # but that's okay because we'll flush it in _end().
         oneblob = ''.join(datalist)
-        f.write(oneblob)
-        self.outbytes += len(oneblob)
+        try:
+            f.write(oneblob)
+        except IOError, e:
+            raise GitError, e, sys.exc_info()[2]
+        nw = len(oneblob)
+        crc = zlib.crc32(oneblob) & 0xffffffff
+        self._update_idx(sha, crc, nw)
+        self.outbytes += nw
         self.count += 1
+        return nw, crc
+
+    def _update_idx(self, sha, crc, size):
+        assert(sha)
+        if self.idx:
+            self.idx[ord(sha[0])].append((sha, crc, self.file.tell() - size))
 
-    def _write(self, bin, type, content):
+    def _write(self, sha, type, content):
         if verbose:
             log('>')
-        self._raw_write(_encode_packobj(type, content))
-        return bin
+        if not sha:
+            sha = calc_hash(type, content)
+        size, crc = self._raw_write(_encode_packobj(type, content), sha=sha)
+        return sha
 
     def breakpoint(self):
+        """Clear byte and object counts and return the last processed id."""
         id = self._end()
         self.outbytes = self.count = 0
         return id
 
     def write(self, type, content):
+        """Write an object in this pack file."""
         return self._write(calc_hash(type, content), type, content)
 
+    def _require_objcache(self):
+        if self.objcache is None and self.objcache_maker:
+            self.objcache = self.objcache_maker()
+        if self.objcache is None:
+            raise GitError(
+                    "PackWriter not opened or can't check exists w/o objcache")
+
     def exists(self, id):
-        if not self.objcache:
-            self._make_objcache()
+        """Return non-empty if an object is found in the object cache."""
+        self._require_objcache()
         return self.objcache.exists(id)
 
     def maybe_write(self, type, content):
-        bin = calc_hash(type, content)
-        if not self.exists(bin):
-            self._write(bin, type, content)
-            self.objcache.add(bin)
-        return bin
+        """Write an object to the pack file if not present and return its id."""
+        self._require_objcache()
+        sha = calc_hash(type, content)
+        if not self.exists(sha):
+            self._write(sha, type, content)
+            self.objcache.add(sha)
+        return sha
 
     def new_blob(self, blob):
+        """Create a blob object in the pack with the supplied content."""
         return self.maybe_write('blob', blob)
 
     def new_tree(self, shalist):
+        """Create a tree object in the pack."""
         shalist = sorted(shalist, key = _shalist_sort_key)
         l = []
         for (mode,name,bin) in shalist:
@@ -417,26 +628,30 @@ class PackWriter:
         l.append(msg)
         return self.maybe_write('commit', '\n'.join(l))
 
-    def new_commit(self, parent, tree, msg):
-        now = time.time()
+    def new_commit(self, parent, tree, date, msg):
+        """Create a commit object in the pack."""
         userline = '%s <%s@%s>' % (userfullname(), username(), hostname())
         commit = self._new_commit(tree, parent,
-                                  userline, now, userline, now,
+                                  userline, date, userline, date,
                                   msg)
         return commit
 
     def abort(self):
+        """Remove the pack file from disk."""
         f = self.file
         if f:
+            self.idx = None
             self.file = None
             f.close()
             os.unlink(self.filename + '.pack')
 
-    def _end(self):
+    def _end(self, run_midx=True):
         f = self.file
         if not f: return None
         self.file = None
         self.objcache = None
+        idx = self.idx
+        self.idx = None
 
         # update object count
         f.seek(8)
@@ -447,36 +662,71 @@ class PackWriter:
         # calculate the pack sha1sum
         f.seek(0)
         sum = Sha1()
-        while 1:
-            b = f.read(65536)
+        for b in chunkyreader(f):
             sum.update(b)
-            if not b: break
-        f.write(sum.digest())
-        
+        packbin = sum.digest()
+        f.write(packbin)
         f.close()
 
-        p = subprocess.Popen(['git', 'index-pack', '-v',
-                              '--index-version=2',
-                              self.filename + '.pack'],
-                             preexec_fn = _gitenv,
-                             stdout = subprocess.PIPE)
-        out = p.stdout.read().strip()
-        _git_wait('git index-pack', p)
-        if not out:
-            raise GitError('git index-pack produced no output')
-        nameprefix = repo('objects/pack/%s' % out)
+        idx_f = open(self.filename + '.idx', 'wb')
+        obj_list_sha = self._write_pack_idx_v2(idx_f, idx, packbin)
+        idx_f.close()
+
+        nameprefix = repo('objects/pack/pack-%s' % obj_list_sha)
         if os.path.exists(self.filename + '.map'):
             os.unlink(self.filename + '.map')
         os.rename(self.filename + '.pack', nameprefix + '.pack')
         os.rename(self.filename + '.idx', nameprefix + '.idx')
+
+        if run_midx:
+            auto_midx(repo('objects/pack'))
         return nameprefix
 
-    def close(self):
-        return self._end()
+    def close(self, run_midx=True):
+        """Close the pack file and move it to its definitive path."""
+        return self._end(run_midx=run_midx)
+
+    def _write_pack_idx_v2(self, file, idx, packbin):
+        sum = Sha1()
+
+        def write(data):
+            file.write(data)
+            sum.update(data)
+
+        write('\377tOc\0\0\0\2')
+
+        n = 0
+        for part in idx:
+            n += len(part)
+            write(struct.pack('!i', n))
+            part.sort(key=lambda x: x[0])
+
+        obj_list_sum = Sha1()
+        for part in idx:
+            for entry in part:
+                write(entry[0])
+                obj_list_sum.update(entry[0])
+        for part in idx:
+            for entry in part:
+                write(struct.pack('!I', entry[1]))
+        ofs64_list = []
+        for part in idx:
+            for entry in part:
+                if entry[2] & 0x80000000:
+                    write(struct.pack('!I', 0x80000000 | len(ofs64_list)))
+                    ofs64_list.append(struct.pack('!Q', entry[2]))
+                else:
+                    write(struct.pack('!i', entry[2]))
+        for ofs64 in ofs64_list:
+            write(ofs64)
+
+        write(packbin)
+        file.write(sum.digest())
+        return obj_list_sum.hexdigest()
 
 
 def _git_date(date):
-    return time.strftime('%s %z', time.localtime(date))
+    return '%d %s' % (date, time.strftime('%z', time.localtime(date)))
 
 
 def _gitenv():
@@ -484,6 +734,9 @@ def _gitenv():
 
 
 def list_refs(refname = None):
+    """Generate a list of tuples in the form (refname,hash).
+    If a ref name is specified, list only this particular ref.
+    """
     argv = ['git', 'show-ref', '--']
     if refname:
         argv += [refname]
@@ -499,6 +752,7 @@ def list_refs(refname = None):
 
 
 def read_ref(refname):
+    """Get the commit id of the most recent commit made on a given ref."""
     l = list(list_refs(refname))
     if l:
         assert(len(l) == 1)
@@ -508,6 +762,15 @@ def read_ref(refname):
 
 
 def rev_list(ref, count=None):
+    """Generate a list of reachable commits in reverse chronological order.
+
+    This generator walks through commits, from child to parent, that are
+    reachable via the specified ref and yields a series of tuples of the form
+    (date,hash).
+
+    If count is a non-zero integer, limit the number of commits to "count"
+    objects.
+    """
     assert(not ref.startswith('-'))
     opts = []
     if count:
@@ -528,12 +791,41 @@ def rev_list(ref, count=None):
 
 
 def rev_get_date(ref):
+    """Get the date of the latest commit on the specified ref."""
     for (date, commit) in rev_list(ref, count=1):
         return date
     raise GitError, 'no such commit %r' % ref
 
 
+def rev_parse(committish):
+    """Resolve the full hash for 'committish', if it exists.
+
+    Should be roughly equivalent to 'git rev-parse'.
+
+    Returns the hex value of the hash if it is found, None if 'committish' does
+    not correspond to anything.
+    """
+    head = read_ref(committish)
+    if head:
+        debug2("resolved from ref: commit = %s\n" % head.encode('hex'))
+        return head
+
+    pL = PackIdxList(repo('objects/pack'))
+
+    if len(committish) == 40:
+        try:
+            hash = committish.decode('hex')
+        except TypeError:
+            return None
+
+        if pL.exists(hash):
+            return hash
+
+    return None
+
+
 def update_ref(refname, newval, oldval):
+    """Change the commit pointed to by a branch."""
     if not oldval:
         oldval = ''
     assert(refname.startswith('refs/heads/'))
@@ -544,6 +836,12 @@ def update_ref(refname, newval, oldval):
 
 
 def guess_repo(path=None):
+    """Set the path value in the global variable "repodir".
+    This makes bup look for an existing bup repository, but not fail if a
+    repository doesn't exist. Usually, if you are interacting with a bup
+    repository, you would not be calling this function but using
+    check_repo_or_die().
+    """
     global repodir
     if path:
         repodir = path
@@ -554,19 +852,29 @@ def guess_repo(path=None):
 
 
 def init_repo(path=None):
+    """Create the Git bare repository for bup in a given path."""
     guess_repo(path)
-    d = repo()
+    d = repo()  # appends a / to the path
+    parent = os.path.dirname(os.path.dirname(d))
+    if parent and not os.path.exists(parent):
+        raise GitError('parent directory "%s" does not exist\n' % parent)
     if os.path.exists(d) and not os.path.isdir(os.path.join(d, '.')):
         raise GitError('"%d" exists but is not a directory\n' % d)
     p = subprocess.Popen(['git', '--bare', 'init'], stdout=sys.stderr,
                          preexec_fn = _gitenv)
     _git_wait('git init', p)
+    # Force the index version configuration in order to ensure bup works
+    # regardless of the version of the installed Git binary.
     p = subprocess.Popen(['git', 'config', 'pack.indexVersion', '2'],
                          stdout=sys.stderr, preexec_fn = _gitenv)
     _git_wait('git config', p)
 
 
 def check_repo_or_die(path=None):
+    """Make sure a bup repository exists, and abort if not.
+    If the path to a particular repository was not specified, this function
+    initializes the default repository automatically.
+    """
     guess_repo(path)
     if not os.path.isdir(repo('objects/pack/.')):
         if repodir == home_repodir:
@@ -576,7 +884,8 @@ def check_repo_or_die(path=None):
             sys.exit(15)
 
 
-def _treeparse(buf):
+def treeparse(buf):
+    """Generate a list of (mode, name, hash) tuples of objects from 'buf'."""
     ofs = 0
     while ofs < len(buf):
         z = buf[ofs:].find('\0')
@@ -590,6 +899,14 @@ def _treeparse(buf):
 
 _ver = None
 def ver():
+    """Get Git's version and ensure a usable version is installed.
+
+    The returned version is formatted as an ordered tuple with each position
+    representing a digit in the version tag. For example, the following tuple
+    would represent version 1.6.6.9:
+
+        ('1', '6', '6', '9')
+    """
     global _ver
     if not _ver:
         p = subprocess.Popen(['git', '--version'],
@@ -620,8 +937,39 @@ def _git_capture(argv):
     return r
 
 
+class _AbortableIter:
+    def __init__(self, it, onabort = None):
+        self.it = it
+        self.onabort = onabort
+        self.done = None
+
+    def __iter__(self):
+        return self
+
+    def next(self):
+        try:
+            return self.it.next()
+        except StopIteration, e:
+            self.done = True
+            raise
+        except:
+            self.abort()
+            raise
+
+    def abort(self):
+        """Abort iteration and call the abortion callback, if needed."""
+        if not self.done:
+            self.done = True
+            if self.onabort:
+                self.onabort()
+
+    def __del__(self):
+        self.abort()
+
+
 _ver_warned = 0
 class CatPipe:
+    """Link to 'git cat-file' that is used to retrieve blob data."""
     def __init__(self):
         global _ver_warned
         wanted = ('1','5','6')
@@ -632,41 +980,60 @@ class CatPipe:
                 _ver_warned = 1
             self.get = self._slow_get
         else:
-            self.p = subprocess.Popen(['git', 'cat-file', '--batch'],
-                                      stdin=subprocess.PIPE, 
-                                      stdout=subprocess.PIPE,
-                                      preexec_fn = _gitenv)
+            self.p = self.inprogress = None
             self.get = self._fast_get
-            self.inprogress = None
+
+    def _abort(self):
+        if self.p:
+            self.p.stdout.close()
+            self.p.stdin.close()
+        self.p = None
+        self.inprogress = None
+
+    def _restart(self):
+        self._abort()
+        self.p = subprocess.Popen(['git', 'cat-file', '--batch'],
+                                  stdin=subprocess.PIPE,
+                                  stdout=subprocess.PIPE,
+                                  close_fds = True,
+                                  bufsize = 4096,
+                                  preexec_fn = _gitenv)
 
     def _fast_get(self, id):
+        if not self.p or self.p.poll() != None:
+            self._restart()
+        assert(self.p)
+        assert(self.p.poll() == None)
         if self.inprogress:
-            log('_fast_get: opening %r while %r is open' 
+            log('_fast_get: opening %r while %r is open'
                 % (id, self.inprogress))
         assert(not self.inprogress)
         assert(id.find('\n') < 0)
         assert(id.find('\r') < 0)
-        assert(id[0] != '-')
+        assert(not id.startswith('-'))
         self.inprogress = id
         self.p.stdin.write('%s\n' % id)
+        self.p.stdin.flush()
         hdr = self.p.stdout.readline()
         if hdr.endswith(' missing\n'):
+            self.inprogress = None
             raise KeyError('blob %r is missing' % id)
         spl = hdr.split(' ')
         if len(spl) != 3 or len(spl[0]) != 40:
             raise GitError('expected blob, got %r' % spl)
         (hex, type, size) = spl
 
-        def ondone():
+        it = _AbortableIter(chunkyreader(self.p.stdout, int(spl[2])),
+                           onabort = self._abort)
+        try:
+            yield type
+            for blob in it:
+                yield blob
             assert(self.p.stdout.readline() == '\n')
             self.inprogress = None
-
-        it = AutoFlushIter(chunkyreader(self.p.stdout, int(spl[2])),
-                           ondone = ondone)
-        yield type
-        for blob in it:
-            yield blob
-        del it
+        except Exception, e:
+            it.abort()
+            raise
 
     def _slow_get(self, id):
         assert(id.find('\n') < 0)
@@ -689,7 +1056,7 @@ class CatPipe:
                 yield blob
         elif type == 'tree':
             treefile = ''.join(it)
-            for (mode, name, sha) in _treeparse(treefile):
+            for (mode, name, sha) in treeparse(treefile):
                 for blob in self.join(sha.encode('hex')):
                     yield blob
         elif type == 'commit':
@@ -702,14 +1069,26 @@ class CatPipe:
                            % type)
 
     def join(self, id):
+        """Generate a list of the content of all blobs that can be reached
+        from an object.  The hash given in 'id' must point to a blob, a tree
+        or a commit. The content of all blobs that can be seen from trees or
+        commits will be added to the list.
+        """
         try:
             for d in self._join(self.get(id)):
                 yield d
         except StopIteration:
             log('booger!\n')
-        
 
-def cat(id):
-    c = CatPipe()
-    for d in c.join(id):
-        yield d
+def tags():
+    """Return a dictionary of all tags in the form {hash: [tag_names, ...]}."""
+    tags = {}
+    for (n,c) in list_refs():
+        if n.startswith('refs/tags/'):
+            name = n[10:]
+            if not c in tags:
+                tags[c] = []
+
+            tags[c].append(name)  # more than one tag can point at 'c'
+
+    return tags